01
科研数字化
Atlas 科研数据分析平台建设
面向单细胞研究的分析与可视化平台。
- 围绕单细胞研究需求开展平台规划与开发，整合数据导入、质控、聚类、基因表达查询及可视化功能。
- 结合 Scanpy 与 AnnData 组织分析流程，支持细胞标注、研究子集管理和 H5AD 结果导出，形成可交互的科研工作台。
RESEARCH & BIOINFORMATICS
张幼麟Youlin Zhang
微生物学硕士 · 生物研发与科研数字化
聚焦生物研发、单细胞组学与生物医学图像分析。结合微生物学背景与数字化工具实践，开展科研分析方案设计及工具开发，探索人工智能在科研场景中的应用。
工作经历
上海迈惠生物科技有限公司
研发·2023 - 至今
教育背景
江苏大学
微生物学 硕士·2020 - 2023
基本信息
1997 年出生
微生物学专业背景
项目经历
SELECTED PROJECTS / 0602
生物信息学
骨骼肌单核转录组研究与数据整合
围绕代谢相关研究开展组学数据整合与分析准备。
- 围绕代谢与运动干预研究，开展多样本单核转录组数据整理，保留供者配对关系及分组信息。
- 使用 R / DropletUtils 进行细胞核调用，整合原始计数与样本信息，核对数据结构及样本对应关系。
03
单细胞疾病研究
增生性瘢痕与成纤维细胞异质性分析
比较正常皮肤与瘢痕组织，探索成纤维细胞状态及基质重塑特征。
- 基于 Seurat、scDblFinder 与 Harmony 完成多样本质控、双细胞识别、整合及细胞注释，进一步开展成纤维细胞亚群分析。
- 通过供者级 pseudobulk / DESeq2、GO 富集及敏感性分析，评估胶原合成与细胞外基质重塑相关信号。
04
肿瘤组学方法实践
乳腺癌单细胞分析流程验证
以公开乳腺癌数据为案例，验证肿瘤微环境分析流程。
- 选取 ER 阳性与三阴性乳腺癌公开样本，开展聚类、标记基因展示及候选细胞类型复核，串联细胞亚群分析与可视化操作。
- 实践 pseudobulk 差异分析、GSEA 与细胞通讯等探索性流程，核对样本分组及输入条件。
05
转录组证据整合
COPD 跨队列转录组与药物再定位评估
结合疾病表达谱与药物响应基因集，评估候选研究方向的证据强度。
- 整合多个公开 COPD 转录组队列，构建药物响应与疾病表达特征的比较流程，评估候选药物的表达逆转信号。
- 采用跨队列一致性与留一队列敏感性分析，检验表达逆转信号的稳健性。
06
数字图像研究
生物医学图像与空间定量分析
面向组织微环境研究的多重荧光图像分析。
- 基于 QuPath 与 Cellpose-SAM 构建多重免疫荧光分析流程，完成组织图像分割、荧光强度测量及空间分布可视化。
- 围绕不同标志物的测量区域与信号特征开展定量整理，输出逐对象数据、质控图和可复查项目，支持组织微环境研究。
专业技能
METHODS & TOOLS- 组学与数据分析
- R / Python 分析实践；Seurat、Scanpy、Harmony、pseudobulk / DESeq2 及通路富集；多样本整合与研究设计核对。
- 生物医学图像
- 多重荧光图像分析、智能分割、空间定量及科研可视化表达。
- 科研工具研发
- 结合 AI 辅助编程开展分析工具与交互平台开发，推动科研需求向工具实现转化。
- 科研方案与交付
- 研究需求梳理、技术方案组织、分析流程规范化及科研成果呈现。